Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EXT1Q16394 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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EXT1Q16394 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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EXT1Q16394 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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EXT1Q16394 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EXT1Q16394 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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