Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NCF4Q15080 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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NCF4Q15080 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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NCF4Q15080 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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NCF4Q15080 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NCF4Q15080 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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