Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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ATP1A4Q13733 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP1A4Q13733 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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