Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
DNASE1L3Q13609 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms