Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TOP3AQ13472 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TOP3AQ13472 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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