Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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UBE2V1Q13404 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
UBE2V1Q13404 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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