Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
REG3AQ06141 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms