Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDK3Q00526 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDK3Q00526 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms