Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAP84074 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAP84074 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAP84074 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAP84074 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAP84074 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms