Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PITX1P78337 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PITX1P78337 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms