Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms