Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TCEA1P23193 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA1P23193 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms