Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-EP13747 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms