Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
HIGD2AQ9BW72 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms