Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CRBNQ96SW2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CRBNQ96SW2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms