Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CEP170Q5SW79 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CEP170Q5SW79 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms