Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
KRTAP21-1Q3LI58 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms