Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PCSK7Q16549 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms