Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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NBR1Q14596 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NBR1Q14596 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NBR1Q14596 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NBR1Q14596 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NBR1Q14596 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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NBR1Q14596 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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NBR1Q14596 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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NBR1Q14596 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NBR1Q14596 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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