Protein–RNA interactions for Protein: Q07326

PIGF, Phosphatidylinositol-glycan biosynthesis class F protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGFQ07326 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PIGFQ07326 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms