Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RUNX1T1Q06455 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RUNX1T1Q06455 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms