Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CHRNEQ04844 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms