Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MPP1Q00013 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms