Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAP84074 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAP84074 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAP84074 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAP84074 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HPCAP84074 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HPCAP84074 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HPCAP84074 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HPCAP84074 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms