Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PCGF2P35227 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms