Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GTF2E2P29084 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms