Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EFNA1P20827 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms