Protein–RNA interactions for Protein: O95198

KLHL2, Kelch-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL2O95198 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
KLHL2O95198 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms