Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 U2AF1L4-205ENST00000585771 572 ntTSL 314.06□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SRSF3-206ENST00000620242 544 ntTSL 214.05□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DDX19A-208ENST00000566167 551 ntTSL 514.05□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PRDM15-204ENST00000433067 6124 ntTSL 514.04□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LSM6-204ENST00000504181 549 ntTSL 214.04□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C12orf4-205ENST00000541014 1049 ntTSL 514.04□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 OGG1-216ENST00000441094 860 ntTSL 314.04□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CBY1-208ENST00000489847 776 ntTSL 214.03□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RAB5C-206ENST00000550406 500 ntTSL 314.02□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 URGCP-208ENST00000455877 591 ntTSL 414.01□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TBC1D10A-202ENST00000393906 578 ntTSL 513.99□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 213.99□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FBXO42-203ENST00000456164 1153 ntTSL 213.98□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PCYOX1-203ENST00000422380 556 ntTSL 413.96□□□□□ -0.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TOP1MT-217ENST00000523417 698 ntTSL 313.94□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SRSF3-201ENST00000339436 1518 ntTSL 213.94□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C2CD5-211ENST00000541310 2449 ntTSL 213.93□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RIPOR1-217ENST00000566907 634 ntTSL 413.91□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HEXA-212ENST00000568260 674 ntTSL 313.91□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PHGDH-218ENST00000641491 986 nt13.91□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PHGDH-220ENST00000641570 1036 nt13.91□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SFI1-214ENST00000464333 3019 ntTSL 213.91□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ALAS2-208ENST00000498636 959 ntTSL 313.9□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ANKFY1-206ENST00000572564 2555 nt13.9□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IFT122-227ENST00000513190 2854 ntTSL 213.9□□□□□ -0.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 QARS-245ENST00000635541 907 ntTSL 313.88□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC2A14-220ENST00000546234 854 ntTSL 213.88□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NCALD-214ENST00000520425 580 ntTSL 413.87□□□□□ -0.191e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 EPB41L1-215ENST00000452261 769 ntTSL 513.87□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ITPK1-212ENST00000557309 770 ntTSL 313.86□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 QARS-237ENST00000635194 582 ntTSL 513.85□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C2CD5-210ENST00000540703 685 ntTSL 513.84□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ELAC1-202ENST00000586966 1505 ntTSL 213.82□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C2CD5-213ENST00000542683 791 ntTSL 513.81□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IFNGR2-204ENST00000421802 727 ntTSL 313.8□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IQGAP3-202ENST00000476565 544 ntTSL 213.8□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CCDC90B-216ENST00000529856 1039 ntTSL 313.78□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-278ENST00000640766 1797 ntTSL 513.76□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-265ENST00000640172 2525 ntTSL 513.75□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PHGDH-221ENST00000641573 1180 nt13.74□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 U2AF1L4-204ENST00000585554 1244 ntTSL 213.73□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNF166-206ENST00000564894 574 ntTSL 413.73□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ACSF3-216ENST00000562204 581 ntTSL 313.72□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PRSS8-205ENST00000567833 1420 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-255ENST00000639386 1723 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 WASHC2A-205ENST00000434114 3287 ntTSL 513.7□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PTK7-218ENST00000493339 2987 ntTSL 213.69□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 OMA1-203ENST00000421528 2105 ntTSL 513.69□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FKBP1A-209ENST00000612074 409 ntTSL 213.68□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00963-213ENST00000622120 355 ntTSL 513.68□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TFEB-214ENST00000433032 168 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNMT1-207ENST00000586588 3094 ntTSL 213.68□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TOP3A-215ENST00000583328 727 ntTSL 213.67□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CD33-201ENST00000262262 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC1A4-202ENST00000471551 461 ntTSL 413.64□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC00963-217ENST00000624009 663 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ATXN7L1-209ENST00000481880 870 ntTSL 213.61□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BMS1P8-203ENST00000567036 614 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PAX6-219ENST00000524853 2221 ntTSL 513.6□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TMEM63B-207ENST00000527188 478 ntTSL 313.6□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DDR1-267ENST00000512336 572 ntTSL 413.6□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RUNX1-213ENST00000469087 1790 ntTSL 1 (best)13.6□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 OGG1-213ENST00000429146 747 ntTSL 313.59□□□□□ -0.238e-6■■■■■ 107
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