Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLDN25C9JDP6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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