Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C9orf172C9J069 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms