Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
SMIM1B2RUZ4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms