Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM175Q9BSA9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMEM175Q9BSA9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM175Q9BSA9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms