Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TREX2Q9BQ50 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms