Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC35A4Q96G79 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms