Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SGF29Q96ES7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SGF29Q96ES7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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