Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EME1Q96AY2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms