Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CATSPER4Q7RTX7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CATSPER4Q7RTX7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms