Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHAF1AQ13111 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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