Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CSTF3Q12996 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CSTF3Q12996 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms