Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RBBP4Q09028 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms