Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EEFSECP57772 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms