Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RAD23AP54725 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAD23AP54725 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms