Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CASP3P42574 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CASP3P42574 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CASP3P42574 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms