Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH1P12830 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH1P12830 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDH1P12830 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDH1P12830 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDH1P12830 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms