Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RHOXF2Q9BQY4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RHOXF2Q9BQY4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms