Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TXNDC8Q6A555 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TXNDC8Q6A555 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms