Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL38Q2WGJ6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms