Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KCNB1Q14721 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNB1Q14721 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms