Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TUBB3Q13509 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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TUBB3Q13509 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TUBB3Q13509 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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